在重庆注册医疗器械公司，需要按照以下步骤进行：
前期准备：
①确定公司名称：准备 5 个以上公司备选名称，以便核名时使用。
②准备注册地址证明：如果是自有房产，需提供房产证及房主身份证复印件；如果是租赁的房产，需提供房屋租赁合同以及房产证复印件。
③明确股东信息：确定公司的股东、法人、监事等人员信息，并准备好他们的身份证原件或复印件。
④确定经营范围：明确公司主要经营的医疗器械类别和具体产品范围，有的范围可能涉及到办理资质或许可证。
⑤确定注册资本：根据公司的经营需求和实际情况确定注册资本金额，并注明股东的出资比例及出资期限。
工商注册：
①核名：登录重庆市的企业登记注册相关系统，进行网上核名，也可以前往当地G商局窗口进行核名申请。
②提交材料：核名通过后，在线或前往G商局窗口提交工商注册材料。
审核与领取营业执照：工商部门对提交的材料进行审核，审核通过后，领取公司的营业执照（三证合一）。
办理医疗器械经营许可证或备案：
①一类医疗器械：如果只经营一类医疗器械，相对简单，只需在营业执照的经营范围中添加医疗器械经营类目即可。
②二类医疗器械：需要办理备案手续。在食品药品监督管理局网站上提交申请，审核通过后，颁发《第二类医疗器械经营备案凭证》。
③三类医疗器械：需要办理《医疗器械经营许可证》。准备相关申请材料，将申请材料提交到当地食品药品监督管理部门，部门会对申请材料进行审核，并可能进行现场核查。审核通过后，颁发《医疗器械经营许可证》。

需要注意的是，具体的注册流程和要求可能会因地区、经营类型等因素有所不同，建议在注册前详细咨询当地的市场监督管理部门和食品药品监督管理部门。

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