由于分子蒸馏技术的科技含量高，应用范围广，因此分子蒸馏技术成为一项工业化应用前景十分广阔的高新技术。包括在聚酞胺树脂工业中，分子蒸馏技术可以用来脱除热敏性物质中的轻组物，而在甲基丙烯酸酯类合成过程中，分子蒸馏技术又可降低热敏性物质的热损伤。此外，利用分子蒸馏技术制取高纯烷基多苷，可以消除或降低生产过程中的环境污染，进行清洁生产等。
随着分子蒸馏技术的不断完善，其应用不止局限于化工工业领域。在芳香油生产工业中，分子蒸馏技术主要用于挥发油类和油脂类等低级性物质的分离纯化，用来脱除原料或产品中的杂质及颜色。
分子蒸馏技术助力食品工业发展
在食品工业中，分子蒸馏技术常常被用于提取和制备，包括提取天然色素、制备高纯度食品添加剂、分离纯化不饱和脂肪酸等。随着分子蒸馏技术应用领域的不断扩大，也为食品工业发展提供了有效便捷的方式。
同时，分子蒸馏在获取风味物质及油脂脱酸、脱色上也有一番作为。分子蒸馏技术在油脂加工中可用于降低毛油的高酸值，此外，在较低的温度下进行玫瑰精油的分子蒸馏，由于浓缩物还原性好，可大幅度提高了玫瑰精油的品质得率。
