同时，酸化池或两相系统是去除和改变，对厌氧过程有作用的物质、改善生物反应条件和可生化性也是厌氧预处理的主要手段，也是厌氧预处理的目的之一。仅考虑溶解性废水时，一般不需考虑酸化作用。对于复杂废水，可在调节池中取得一定程度的酸化，但是完全的酸化是没有必要的，甚至是有害处的。因为达到完全酸化后，污水pH会下降，需采用投药调整pH值。另外有证据表明完全酸化对U：SB反应器的颗粒过程有不利的影响。对以下情况考虑酸化或相分离可能是有利的：当采用预酸化可去除或改变对甲烷菌有毒或性化合物的结构时；当废水存在有较高的Ca2+时，部分酸化可避免颗粒污泥表面产生CaCO3结垢；当处理含高含悬浮物和/或采用高负荷，对非溶解性组分去除有限时；在调节池中取得部分酸化效果可以通过调节池的合理设计取得。
