直接接触性用水

尽管市政供水通常不含有害或致病微生物，但也不完全如此。此外，来自个别水源，如天然泉水或井水也可能受到污染。任何用于食品或饮料产品的配料水，或与产品直接接触的水，都可能成为污染源。紫外线能够在不使用化学物质、不进行加热的情况下对产品进行消毒。同时，紫外线消毒法能使生产用水得到再次利用，既节约成本又在保障产品质量的基础上提高了产量。

CIP(就地清洗)漂清用水

微生物安全性对用作最后CIP漂洗用水及消毒方案都是至关重要的。全自动紫外线消毒系统能够结合CIP漂清周期使用，确保最终的漂清用水不会再次引入微生物污染。由于中压紫外灯管自身的机械强度高，它们不会受到CIP水温突变的影响。

过滤消毒

反渗透(RO)和颗粒状活性碳(GAC)过滤法常被用来过滤生产用水，但是也可能成为细菌的滋生地。紫外线能够有效地消毒RO和GAC的产水，而且已在加工产业中使用多年。

脱氯

GAC过滤器常被用来脱去生产用水中的，除去由于氯水消毒“挥发出”的气味，从而保证最终产品的味道不走样、没有任何多余的味道或气味。将紫外线消毒系统安装在GAC过滤器前，能够改善GAC过滤器的性能，延长活性碳的使用寿命，从而降低运营成本。

糖浆

糖浆可能是微生物最理想的滋生场所。尽管糖份含量很高的糖浆并不利于微生物的生长，但是休眠的孢子会在糖浆被稀释后恢复活性。在加工糖浆和稀释时进行紫外线消毒能够确保休眠的孢子完全失去活性。